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同样建NJ树,为什么MEGA算得那么快,phylip算nj之前要算dist,mega也算吗?——没用过phlip,不知道具体情况,但是构建NJ树的基础都是先计算出两两距离,然后再根据距离大小画出树图,至于为啥MEGA要快,可能是程序的不一样吧,就像我用PAUP计算MP和NJ树时,特别是序列很多的时候,比MEGA快得不是一倍两倍。
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